抗原决定簇（antigenic determinant）是抗原物质分子表面或其他部位，具有一定组成和结构的特殊化学基团，且能与其相应抗体发生特异性结合的结构。同时，结构已经确定的抗原决定簇被称为抗原表位。
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其它常用序列分析工具：抗原决定簇预测(v1) 、疏水性分析工具 、信号肽分析