抗原是一种能引发机体产生免疫应答并且可以被抗体结合的物质。抗原通常是蛋白质，肽或多糖等物质，而脂质和核酸可与这些分子结合形成更复杂的抗原，如脂多糖。抗原根据来源、性质和功能等不同可划分为不同的类型。
抗原分类
1．根据来源分类
外源性抗原（exogenous antigen）
外源性抗原是指通过吸入，摄取或注射等方式从外部进入体内的抗原。通过胞吞或吞噬作用，将外源抗原带入抗原呈递细胞（APC）并降解成小肽，然后，APC通过使用MHC II型分子将片段呈递给T辅助细胞。外源性抗原是最常见的抗原，包括可能引起过敏的花粉或食物，以及可能导致感染的细菌和其他病原体的分子成分。
内源性抗原（endogenous antigen）
内源性抗原在正常细胞内产生，是正常细胞代谢或病毒/细胞内细菌感染的结果。内源性抗原以抗原肽-MHC I类分子复合物形式提呈给CD8+T细胞。经蛋白酶体降解产生的内源性抗原肽必须进入内质网才能与I类分子结合，这一转运过程依赖抗原加工相关转运物(transporter associated with antigen processing，TAP)。如病毒感染的细胞所合成的病毒蛋白、肿瘤细胞合成的肿瘤抗原等属于内源性抗原。
2．根据免疫原性（功能）分类
完全抗原（complete antigen）
完全抗原简称抗原，具有免疫原性和免疫反应性双重性质。大多数蛋白质、细菌、病毒、细菌外毒素等都属于完全抗原。
不完全抗原（incomplete antigen）
不完全抗原又称半抗原（hapten），是一种小分子（通常是非蛋白质物质），只具有免疫反应性而无免疫原性。
半抗原与蛋白质载体结合后，就获得了免疫原性，能够刺激机体形成特异性抗体。肺炎球菌的荚膜多糖、β溶血性链球菌的多糖等属于不完全抗原。
3. 根据抗体产生时是否需要T细胞辅助分类
胸腺依赖性抗原（T cell dependent antigen）
需要T细胞和巨噬细胞的辅助才能激活B细胞产生抗体的抗原称为胸腺依赖性抗原。此种类型的抗原结构复杂（如红细胞、S蛋白），并且会产生免疫记忆。大多数抗原都属于T依赖性抗原。
胸腺非依赖性抗原（T cell independent antigen）
直接刺激B细胞产生抗体，不需要T细胞辅助的抗原称为胸腺非依赖性抗原。此类抗原不会产生免疫记忆，只能产生IgM型抗体，并且免疫力不会持续很长时间。肺炎球菌荚膜多糖、细菌脂多糖、鞭毛蛋白等属于T非依赖性抗原。
4.根据抗原的种属性分类
异种抗原（xenoantigen）
来源于不同物种的抗原，如异种动物血清，各种微生物及其代谢产物等。
同种异型抗原（alloantigen）
相同物种的不同个体之间产生的抗原，如红细胞抗原A和B。
自身抗原（autoantigen）
自身抗原是正常的“自身”蛋白质或核酸的复合物，受到宿主免疫系统的攻击，引起自身免疫性疾病。自身抗原分为隐蔽的自身抗原、改变的自身抗原等，如眼晶状体蛋白。
异嗜性抗原（heterophilic antigen）
嗜异性抗原是在不同物种的细胞中发现的相同抗原，由脂蛋白-多糖复合物组成，如Forrssman抗原，交叉反应微生物抗原等。
综上所述，我们可以从多个不同角度对抗原进行分类，通过对不同类型抗原的学习，有助于我们进一步理解抗原-抗体的相互作用、单克隆抗体和多克隆抗体制备的原理等抗体工程技术。